Spinalvæske: Forurening af spinalvæskeprøven kan ske fra patientens hud og omgivelser. Det vil ofte være bakterier, som sjældent fremkalder meningitis, og spinalvæsken vil almindeligvis være uden pleocytose.
Sterile områder: Ved korrekt prøvetagning er ethvert bakteriefund patologisk.
Sekret fra nedre luftveje: Prøvens egnethed, vurderet ved mikroskopi, er afgørende for tolkningen af det bakteriologiske fund. Mangel på cylinderepitel, leukocytter samt større mængder pladeepitel tyder på, at prøven er uegnet. Ved BAL kan tilblanding af svælgsekret næsten undgås.
Urin: Svaret oplyser bakterietallet, hvis der er > 1000 (103) pr. mL urin af en eller flere urinvejspatogene bakterier. For ureterurin, blærepunktururin eller urin udtaget ved perkutan punktur fra nyrepelvis oplyses også mindre bakterietal. Desuden angives de fundne bakteriers resistensforhold og art. I ureterurin kan selv meget små bakterietal være tegn på infektion. Blærepunktururin er normalt steril, og selv små bakteriemængder må derfor tillægges betydning, men det er reglen, at bakterietallet er stort ved urinvejsinfektion. Bakterietal 103/mL i midtstråle- og kateterisationsurin af ovenstående bakterier er oftest tegn på urinvejsinfektion, især hvis det kan bekræftes ved gentagen urindyrkning hos en patient med symptomer på urinvejsinfektion. Hvis patienten ikke har symptomer på urinvejsinfektion, og 2 urinprøver taget med et døgns mellemrum viser vækst af samme bakterier med bakterietal 105/mL urin, har patienten asymptomatisk bakteriuri. Ved prøve fra kateter à demeure tillader bakterietallet ikke at afgøre, om der foreligger urinvejsinfektion. Prøven kan indeholde bakterier fra vækst i kateteret eller posen.
Sårsekret og sekret fra øvre luftveje, øjne, øre: Fund af potentielt patogene bakterier er ikke ensbetydende med, at man har fundet det ætiologiske agens. Angivelse af resistensforhold for en funden bakterie betyder ikke, at antibiotikabehandling tilrådes. Det kan være nødvendigt at konsultere en klinisk mikrobiolog.