Subtyperne 1, 2, 3 og 4 er almindeligt forekommende hos danskere, mens smitte med subtype 5, 6, 7, 8 og 9 sandsynligvis sker overvejende fra dyr til mennesker. I Danmark ses disse subtyper i mindre end 10% af Blastocystis-bærere.
På genom-niveau er de forskellige subtyper forskellige og det kan ikke udelukkes, at der ses udsving i klinisk præsentation mellem de enkelte subtyper.