Referencelaboratorium for svampe

Indledning

Laboratoriet varetager den nationale overvågning af alvorlige dybe svampeinfektioner og C. auris samt assisterer med undersøgelse, identifikation og resistensbestemmelse af svampe. Laboratoriet udfører ca. 11.000 diagnostiske analyser om året. Laboratoriet er internationalt EUCAST Udviklings laboratorium for Svampe og assisterer både nationalt og internationalt med resistensbestemmelse af svampe.

Undersøgelser

Rutineundersøgelser

• Hurtig påvisning og identifikation af hudsvampeinfektion i hud, hår og negle ved PCR
• Påvisning og identifikation af gær og skimmelsvampe i klinisk prøvemateriale
• Resistensbestemmelse af gær, skimmelsvampe og hudsvampe ved hjælp at EUCAST reference metode E.Def 7.4, E.Def 9.4, E.Def 10.2 and E.Def 11.0
• Påvisning af antigen fra Aspergillus, Cryptococcus og Candida, samt antistoffer mod Candida, Aspergillus, Coccidioides og Histoplasma
• Aspergillus PCR inklusiv påvisning af de to hyppigste azol resistensmutationer
• Mucorales og Fusarium PCR tests. Påviser de hyppigste forekommende humanpatogene arter, dvs henholdsvis Rhizopus microsporus, Rhizopus arrhizus, Mucor spp., Lichtheimia spp.,Rhizomucor spp. og Fusarium solani kompleks, Fusarium dimerum kompleks og Fusarium oxysporum kompleks
• Terapeutisk koncentrationsmåling af systemiske svampemidler inklusiv fluconazol, voriconazol, isavuconazole, itraconazol, posaconazol og flucytosin
  
  

Specialanalyser

• PCR diagnostik i panfungal format (ITS og mikrobiom)
• Arts-specifikke PCR diagnostik for Mucorales, Fusarium og Candida
• Identifikation af svampeisolater ved hjælp af morfologi og ITS, TEF, beta-tubulin og calmodulin sekventering
• Typning af A. fumigatus og A. flavus i epidemiologisk sammenhæng
• Påvisning af echinocandin resistensmutationer i Candida og Aspergillus
• Påvisning af azol resistensmutationer i Aspergillus (og Candida)
• Påvisning af terbinafin resistensmutationer i Trichophyton
   

Referencefunktioner

National overvågning af blodinfektioner med svampe og af azolresistens i Aspergillus samt af C. auris kolonisation og infektioner.

Rådgivning

Afsnittet deltager aktivt med rådgivning i forbindelse med udredning og behandling af svampeinfektioner og har jævnligt akademikere udefra til oplæring i resistensbestemmelse.

Netværk

Danmark

De danske fungæmi og aspergillus netværk, der indeholder alle danske klinisk mikrobiologiske afdelinger.

Afdelingens ledende Overlæge er samtidigt professor på Klinisk mikrobiologiske afdeling på Rigshospitalet med et stærkt samarbejde med denne og de kliniske afdelinger på Rigshospitalet. Afsnittet har desuden et samarbejde med Institut for Agroøkologi ved Århus Universitet og med BUILD, Institut for Byggeri, By og Miljø ved Aalborg Universitet.

Internationalt

Laboratoriet er EUCAST Udviklings laboratorium for Svampe. Afsnittes fagchef er chair for EUCAST AFST steering committee, grundlægger af og past-president for Nordic Society for Medical Mycology (NSMM), medlem af European Fungal Infection Study Group (EFISG) og en række andre mykologiske selskaber og studiegrupper.