Påvises DNA fra B. pertussis er det foreneligt med aktuel kighoste. Påvisning af DNA fra B. parapertussis betyder at patienten har en luftvejsinfektion, som kan minde om kighoste men er mildere og ufarlig. Ved analysesvaret "Bordetella species påvist" skal forstås, at der er påvist DNA fra en Bordetella art, men at det ikke er muligt at fastslå hvilken. Ved klinisk eller epidemiologisk mistanke om kighoste bør svaret derfor tolkes som "sandsynligvis B. pertussis", og gældende retningslinjer bør følges. Asymptomatisk bærertilstand er beskrevet. I sjældne tilfælde kan et positivt analysesvar for B. parapertussis skyldes DNA fra B. bronchseptica, der som oftest stammer fra smittet hund eller kat og sjældent giver symptomer humant.
Da der ved PCR påvises både levende og døde bakterier, kan PCR ikke anvendes til behandlingskontrol eller til at afgøre om patienten smitter.
Negativt analyseresultat udelukker ikke kighoste. Ved symptomer i mere end 3-4 uger er følsomheden af analysen lav.
Undersøgelsen er akkrediteret af DANAK efter ISO 17025.