Adenovirus (DNA) (genotypning) (R-nr. 2127)

Behov for genotypning af allerede påvist adenovirus hos en patient, hvor behandlingen vil afhænge af genotypen.

Et af følgende prøvematerialer:

• Spinalvæske 0,5 mL
• Urin (1 mL) i plastrør uden tilsætning
• Podninger, sekreter eller vævsbiopsier
• Fæces uden tilsætning (mindst 1 mL)

Om prøvematerialet:

• Næsepodning foretages fra bagerste del af næsehulen.
• Podninger indsendes i UTM/VTM (virus transportmiddel)/ESwab. Kulpodepind kan ikke anvendes. Eswab medium kan dog ikke anvendes til overvågningsprøver, idet virus dyrkning hæmmes af mediet.
• Nasopharynxsekret opsamles ved nasopharyngeal sugning.
• Ekspektorat opsamles i ekspektoratdåse.
• BAL-væske (0,5 mL, dog gerne 1,5 mL) opsamles i et sterilt tørglas.
• Analysen kan udføres på andre prøvematerialer - dog med forbehold for svaret.

Blanket nr. 2 "Virus" (blå kant).

Prøven sendes samme dag. Kan prøven ikke sendes samme dag skal den opbevares på køl (2-8 °C) og sendes hurtigst muligt.

NB: Ved hasteprøver anmeldes prøven telefonisk til vagthavende virolog på telefon 4033 6379 indenfor normal arbejdstid.

Svar afgives indenfor 2 uger efter prøvens modtagelse. N.B. Mulighed for hurtigere svartid efter telefonisk aftale.

Prøven svares ud med en adenovirus genotype eller ”Ej påvist”, såfremt adenovirus ikke er genfundet.

Analysen skal kun bestilles, såfremt patienten allerede er testet positiv for adenovirus, og kendskab til genotypen har behandlingsmæssige konsekvenser.

Såfremt det ønskes at teste patienten for adenovirus, kan dette bestilles via

• Adenovirus, R-nr. 226. Anvendes ved gastroenteritis og detekterer kun adenovirus genotype F40 og 41.
• Adenovirus, R-nr. 254. Anvendes ved mistanke om luftvejsinfektion eller systemisk infektion og detekterer alle adenovirus genotyper.
• Adenovirus, kvantitativ, R-nr. 2001. Anvendes ved mistanke om systemisk infektion hos immunsupprimerede, hvor kvantitering bruges til monitorering af behandlingsrespons.
• Luftvejsvirus, pakke, R-nr. 680. Anvendes ved mistanke om luftvejsinfektion og indeholder test af flere forskellige luftvejsvirus.

• Adenovirus (DNA) (fæces) (R-nr. 226)
• Adenovirus (DNA) (R-nr. 254)
• Adenovirus (DNA) (kvantitativ) (R-nr. 2001)
• Luftvejsvirus, pakke (influenza- (A, B), RSV (A, B), metapneumo-, parainfluenza- type 1, 2, 3, 4, adeno-, corona- OC43, 229E, NL63, HKU1, SARS CoV 2, rhino- og enterovirus) (PCR) (R-nr. 680)

RT-PCR amplifikation efterfulgt af sanger sekventering og/eller dybdesekventering ved next generation sequencing.

IVDR risikoklasse: B
In house komponent: Mastemix (primere og prober)
Internt reference nummer: R-nr. 2127
Komponenten opfylder generelle krav til sikkerhed og ydeevne.

NPU09301 Syst(spec.)—Adenovirus; taxon(proc.) = ?
NPU09304 Csf—Adenovirus; taxon(proc.) = ?
320842014000000 Adenovirus genotypning - Ekspektorat
320842016000000 Adenovirus genotypning - Trachealsekret
320842017000000 Adenovirus genotypning - Nasopharynxsekret
320843000100000 Adenovirus genotypning - Urin
320844001000000 Adenovirus genotypning - Biopsi
320845000000000 Adenovirus genotypning - Podning
320845000000000 Adenovirus genotypning - Podning
320846015000000 Adenovirus genotypning - Bronkoalveolær lavage (BAL)
320841020000000 Adenovirus Genotypning - Spinalvæske
320843043300000 Adenovirus Genotypning - Fæces

NPU09301 Syst(spec.)—Adenovirus; taxon(proc.) = ?
NPU09304 Csf—Adenovirus; taxon(proc.) = ?

Virologi & Mikrobiologisk Beredskab
Virus PCR

T. 3268 8600
F. 3268 3148
@. afdvmb@ssi.dk

Telefontid:
Mandag-fredag kl. 8.00-15.00