Genotypning af mykobakterier, både arter tilhørende Mycobacterium tuberculosis complex (M. tuberculosis, M. bovis, M. bovis BCG, M. africanum, M. microti, M. canettii, M. caprae og M. pinnipedi) og atypiske mykobakterier.
Alle mykobakterier har en karakteristisk genotype (DNA-profil). Genotypning kan derfor benyttes til at sandsynliggøre, hvorvidt stammer er beslægtede. Dette bruges fx til udredning af; TB-udbrud, kontamination, smitteopsporing, erhvervsbetinget TB m.fl. I særlige tilfælde kan genotypning også bruges som supplement til genotypisk resistensbestemmelse og speciesbestemmelse.
Genotypning foretages normalt automatisk i Danmark (uden beregning) på isolater fra nye Mycobacterium tuberculosis complex positive patienter som led i TB-overvågningen. Herudover foretages genotypning på udvalgte atypiske mykobakterier som led i standardundersøgelsen.