Human papillomavirus (DNA) alle typer - og andre virus (R-nr. 2067)

Udredning af virusinfektioner i hud, penis, omkring anus, hoved-hals og andre lokalisationer samt diagnostik/differentialdiagnostik ved mistanke om infektion med virus. Analysen påviser tilstedeværelsen af HPV og alle andre humanpatogen virus hos kvinder, mænd og børn på hud og slimhinder, fx HSV-1, HSV-2, HIV, CMV, molluskum contagiosum (vandvorter), HPV typer, ko-kopper og andre poxvirus m.fl. Diagnostik og typning af alle HPV ved særlige HPV inducerede læsioner (fx vulvafissurer, Mb. Bowen, Hick’s Disease, treman-syndrom, papillom-lignende elementer). Alle påviste virus udsvares.

Et af følgende prøvematerialer:

• Børsteskrab
• Biopsier fra suspekte områder
• Kondylomer (biopsi)

Podning, børsteskrab eller biopsier fra ano-genitale kondylomer, fissurer og andre elementer på hud eller slimhinder mistænkt for HPV infektioner eller andre virusinfektioner.

Analysen kan udføres på andre prøvematerialer - dog med forbehold for svaret.

Undersøgelsen kan rekvireres i WebReq under laboratoriet Statens Serum Institut eller på blanket nr. 2 "Virus" (blå kant).

Prøvematerialets art samt diagnose eller klinisk problemstilling ønskes anført.

Ved podning kan anvendes cytobrush. Fugtet vatpind kan undtagelsesvis anvendes ved nogle læsioner fx fra penis hos mænd. Biopsier, hele elementer eller cytobrush/skrab fra læsioner mistænkt for virusinfektion. Cytobrush/vatpind/biopsi anbringes straks i virustransportmedium (VTM) eller ca. 1 mL sterilt saltvand og prøvepinde afklippes således, at hætten let kan skrues på. Biopsier anbringes i VTM eller i ca. 1 mL sterilt saltvand eller vand. Skyllevæske fra fx cervix kan indsendes i plastrør uden tilsætning. Prøven emballeres i beskyttelsesrør. Unødig transporttid skal undgås.

• HPV: Påvist (typerne angives)/Ikke påvist
• Andre virus: Påvist (virus angives)/Ikke påvist

Undersøgelsen udføres ca. hver 7.-14. dag.

HPV genotypeanalysen understøtter udredning i forbindelse med fund af vorter, kondylomer, suspekte hudområder etc. Alle HPV hudtyperne bestemmes ligeledes med numre. Alle virusfund udsvares.

NB: Ved denne analyse oplyses alle virusfund.

For yderligere tolkning ring til Mikrobiologisk Diagnostik & Virologi på vagttelefon 4033 6379.

Undersøges vha. MetagenomicsNGS analyse.

Prøven undersøges for alle typer af HPV og andre humanpatogene virus. Alle tilstedeværende HPV typer og alle øvrige humanpatogene RNA- og DNA-virus identificeres og angives fra hud, slimhinder og biopsier.

Analysen udføres med NGS teknologi, som muliggør en meget præcis og sensitiv analyse af tilstedeværende virus i prøvematerialet. Forud for sekventering ekstraheres DNA/RNA fra prøvematerialet. Herefter fanges og opformeres alle virus gensekvenser ved hybridisering med prober, der dækker mere end 3000 human-relevante virus genomer. En positiv prøve indeholder ofte mere end en HPV type (multiple typer) og kan indeholde andre virus end HPV. Analysens styrke er at alle tilstedeværende humanpatogene virus i prøven påvises og types med stor præcision. I nogle tilfælde opnås den komplette virus genomsekvens, dette kan dog ikke garanteres.

IVDR risikoklasse: C
In house komponent: Mastermix (primere og prober)
Internt reference nummer: R-nr. 2067
Komponenten opfylder generelle krav til sikkerhed og ydeevne.

HPV DNA medgenotypning, MetagenomicsNGS, virus påvisning 

SSI00036
321804001500000 Human papillomavirus (HPV) DNA/RNA - Børstebiopsi
321804001000000 Human papillomavirus (HPV) DNA/RNA - Biopsi

SSI00036 HPV(DNA) alle typer, og andre virus
SSI00037
SSI00038

Virologi & Mikrobiologisk Beredskab
Virus Genomics (VIG)

T. 3268 8600
F. 3268 3148
@. afdvmb@ssi.dk

Telefontid:
Mandag-fredag kl. 8.00-15.00