Fund af BK-virus hos nyretransplanterede korrelerer til nefropati, men er også afhængig af den immunosuppressive behandling. Fund af BK-virus i urin er ikke ualmindelig, men fund af > 200 kopier/mL plasma signalerer mulig BK-virus induceret nefropati. Manglende urinudskillelse af BK-virus gør diagnosen BK-virus nefropati lidet sandsynlig. Hos andre transplanterede patienter er sammenhængen mellem BK virus og nefropati mindre klar.