Primærvaccination består af tre doser. Der kan eventuelt være behov for boostervaccination.
Børnedosis anvendes i aldersgruppen 1 år til og med 15 år, fra 16 år anvendes voksen dosis.
For at opnå immunitet før skovflåten begynder sin aktivitet om foråret, anbefales det at give første og anden dosis i løbet af vintermånederne. Disse doser skal gives med 1-3 måneders interval. Hvis der er behov for at opnå en hurtig immunrespons, kan anden dosis gives to uger efter første dosis. Den tredje dosis bør gives mellem 5-12 måneder efter den anden vaccination. Hvis det anbefalede interval mellem vaccinationerne er overskredet, gøres vaccinationsserien færdig. Man starter ikke forfra.
I de tilfælde, hvor den vaccine man er begyndt med (enten Encepur eller Ticovac) ikke kan skaffes inden for en rimelig periode under hensyn til det normale vaccinationsprogram, dvs. svarende til 3 måneder mellem 1. og 2. dosis og 12 måneder mellem 2. og 3. dosis for begge vacciner, og for både børne- og voksendosis, kan man i denne mangelsituation færdiggøre vaccinationsserien med den anden TBE-vaccine, der er til rådighed. Man skal dog tilstræbe at give de to første doser med samme produkt.
Dog gælder det ikke for Encepur ekspres program, hvor der skal anvendes Encepur ved alle fire vaccinationer.
Ovenstående anbefaling om krydsvaccination er en dansk anbefaling ud over hvad der nævnes i produktresuméet. Samme anbefaling anvendes i andre europæiske lande i perioder med mangel på TBE-vacciner.
Vaccinen gives intramuskulært i overarmen (m.deltoideus). Se Injektionsteknik.
For yderligere detaljer henvises til produktresuméet.