Fødevarebårne bakterier og typning
Laboratoriet er ansvarlig for den laboratoriebaserede overvågning af vand- og fødevarebårne infektioner samt andre mave-/tarminfektioner i Danmark. Disse overvågningsdata rapporteres til nationale og internationale myndigheder. Laboratoriet er ansvarligt for karakterisering af bakterier, som indsendes fra landets klinisk mikrobiologiske laboratorier.
Laboratoriet anvender specialiserede molekylære typningsmetoder på en bred vifte af bakterier til udredning af smitteveje og smittekilder, påvisning af udbrud, følge trends, mm.
Desuden udføres forskning i relation til vand- og fødevarebårne infektioner i samarbejde med danske og internationale samarbejdspartnere.
Bakterier:
-
Salmonella
-
Campylobacter
-
Listeria
-
Clostridium difficile
-
E. coli og Klebsiella
- Øvrige (Yersinia enterocolitica, Shigella)
Undersøgelser
Molekylære typningsmetoder:
- Pulsed-field gel elektroforese (PFGE)
- Multi-locus variable number of tandem repeat analysis (MLVA)
- PCR-ribotypning
- 16S sekventering til identifikation af bakterier
- Multi-locus sekvensanalyse (MLST)
- Diverse sekvens-baserede metoder
Andre metoder:
- Resistensbestemmelse
- Påvisning og karakterisering af resistens-gener
- Påvisning og karakterisering af virulensgener
Forskning og udvikling
- Udvikling af molekylære typningsmetoder
- Smitteveje og –kilder
- Virulensmekanismer
- Antibiotikaresistens
- Populationsstruktur og phylogeni
Rapportering
Sidst redigeret 13. august 2010