WHO Collaborating Centre for Reference and Research on Escherichia and Klebsiella
Laboratoriet er det nationale referencelaboratorium for typning af E. coli og Klebsiella. Centeret indsamler overvågningsdata til nationale og internationale myndigheder. Centeret koordinerer typning og deltager i forskningsprojekter i ind- og udland, samt rådgiver vedrørende detektion og typning. Det fungerer som ECDC’s mikrobiologiske støttelaboratorium og organiserer eksterne kvalitetsprogrammer (EQA) i samarbejde med ECDC i Stockholm, Global Foodborne Disease Network (GFN) og WHO’s Department of Food Safety and Zoonoses (FOS) i Genève
Undersøgelser
Serotypning af Escherichia coli: Komplet karakterisering af bakteriens somatiske (O-), svingtråds- (H-) og kapsel- (K-) antigener.
Serotypning af Klebsiella: Karakterisering af bakteriens kapsel- (K-) antigen.
Virulenskarakterisering: Påvisning af relevante virulensfaktorer (adhæsiner, toksiner mv.) vha. DNA teknikker og inokulation i cellekulturer. Endvidere produktion af Verocytotoksin, enzymet b-glucuronidase og Hæmolysin, samt udvalgte biokemiske reaktioner.
De fleste rutineundersøgelser er akkrediterede af DANAK efter ISO 17025.
Undersøgelserne giver svar på hvilken af følgende patogene E. coli grupper et indsendt isolat tilhører:
| VTEC |
Verotoksinproducerende E. coli |
| EHEC |
Enterohæmorrhagiske E. coli (undergruppe af VTEC) |
| A/EEC |
Attaching and Effacing E. coli (eae positiv, ikke klassisk EPEC) |
| EPEC |
Enteropatogene E. coli. (Klassiske og nye O:H serotyper); en opdateret liste kan altid fås ved henvendelse til fagchef Flemming Scheutz |
| EIEC |
Enteroinvasive E. coli |
| ETEC |
Enterotoksigene E. coli. Herunder også isolater, der kun er positive for astA |
| EAggEC |
Enteroaggregative E. coli |
| DAEC |
Diffusely Adherent E. coli |
| ExPEC |
Ekstraintestinale patogene E. coli |
| UPEC |
Urinvejspatogene E. coli |
Ikke akkrediterede undersøgelser omfatter:
DNA fingeraftryk: Pulsed Field Gel Electrophoresis (PFGE), sekventering af generne for vero toksin (vtx), subtypning af vtx generne. Serotypning af P fimbrier og Hæmagglutination hos isolater fra urinvejsinfektioner, blod og meningitis.
Referencefunktioner
Teknisk ekspertise
Afklaring af bakteriernes virulens, smitteveje i produktionsmiljø, fx. ved løbende overvågning, som led i kvalitetskontrol og i konkrete situationer hvor uønsket smitteoverførsel kan have fundet sted.
Rådgivning
Afdelingen deltager gerne aktivt med rådgivning i forbindelse med udredning af mulige smitteveje og vurdering af deres relevans (evt. HACCP).
Det har sjældent værdi kun at undersøge enkeltstående bakteriekulturer.
Undersøgelsen prissættes individuelt.
Undersøgelsen udføres kun efter aftale.
Rapportering
Netværk
- Danmark
- Det danske E. coli netværk, der indeholder alle danske klinisk mikrobiologiske afdelinger
- Internationalt
-WHO Collaborating Centre for Reference and Research on Escherichia and Klebsiella
- Food and Waterborne Diseases (FWD)-ECDC: Flemming Scheutz er medlem af FWD Coordination group, der fungerer som styregruppe for overvågningen af fødevare- og vandbårne infektioner i EU. Gruppen tilrettelægger den årlige workshop i samarbejde med ECDC
- WHO Food Safety og Global Foodborne Disease Network (GFN): Samarbejde om External Quality Assurance (EQA) programmer
- Flemming Scheutz er medlem af The International VTEC Symposium Steering Committee (IVSSC) 8th International Symposium on Shiga Toxin (Verocytotoxin) - Producing Escherichia coli Infections. Kongresserne afholdes hvert tredje år. Den næste bliver VTEC2012 i Holland.
- Pathogenic E. coli Network (PEN), EU Coordination Action Programme
- Konsulent for Community Reference Laboratories (CRL) network, EU's netværk for Food and Feed på veterinærsiden.
Projekter/aktiviteter/forskning
- Seven new O antigens
- Standardisation of serotyping techniques
- Nomenclature of Verocytotoxins
- Molecular method for K. pneumoniae capsule typing
- Characterisation of highly virulent K. pneumoniae isolates
Kvalitetsprogrammer
Laboratoriet fungerer som ECDC’s mikrobiologiske støttelaboratorium og organiserer årligt en EQA af sero- og virulenstypning af 10 VTEC stammer.
I Danmark organiserer laboratoriet et årligt EQA program, der fa 2011 vil omfatte 15 forskellige typer af DEC, der er repræsentative for danske forhold.
Sidst redigeret 27. februar 2012