E. coli (STEC) overvågning (R-nr. 1062) Udgået
Se håndbog vedr. Overvågningsanalyser.
Indikation
Indsendelse af shiga-toksin-producerende Escherichia coli (STEC) kultur til national overvågning.
Prøvemateriale, tidspunkt og evt. prøvetagning
Til analysen kan indsendes kultur.
I udbrudssituationer og på klinisk indikation (primært ved mistanke om HUS) kan indsendes fæces eller DNA-eluat.
Rekvirering
Blanket nr. 9 "Reference, overvågning og specialundersøgelse" (brun kant).
Emballering, opbevaring og forsendelse
SSI transportmedium (Stuarts) eller lignende til kultur.
Kan prøven ikke sendes samme dag skal den opbevares på køl (2-8 °C) og sendes hurtigst muligt.
Ved indsendelse af DNA-eluat minimum 50 μl.
Svar
Vækst eller ingen vækst.
Ved vækst svares art, serotype, virulenskarakterisering og sekvens type.
Ved DNA-eluat svares stx-subtype og/eller O-gruppe.
Svartid
Svar afgives 1-2 uger efter prøvens modtagelse.
Bemærkning
Helgenomsekventering på alle indsendte isolater bruges til overvågning af typer og udbrudsdetektion. Data og prøveanalyser samles og afrapporteres på overvågning i tal, grafer og kort. Data bruges endvidere i forbindelse med udarbejdelsen af Annual Report on Zoonoses in Denmark og sendes til ECDC's europæiske overvågning af zoonoser.
Analysens princip
Bestemmelse af art, serotype, virulenskarakterisering og sequence type (ST) udledt fra helgenomsekvensering. Ved DNA-eluat anvendes PCR til virulenskarakterisering.
Synonym
Vero-toksin-producerende Escherichia coli (VTEC)
Bestillingskode
121643043300000 E. coli (STEC) Overvågning - Fæces
121647011100000 E. coli (STEC) Overvågning - Kultur af mikroorganisme
121643000100000 E. coli (STEC) Overvågning - Urin
Svarkode
SSI00069
Pris
Artikel nr. | Pris 2024 |
---|---|
101743 | Gratis |
Henvendelse
Bakterier, Parasitter & Svampe
Tarmbakteriologisk Laboratorium
T. 3268 8600
@. afdMI@ssi.dk
Telefontid:
Mandag-torsdag kl. 8.00-15.30
Fredag kl. 8.00-15.00