Tarmbakteriologisk laboratorium
Det nationale referencelaboratorium for enteropatogene bakterier
Tarmbakteriologisk laboratorium på Statens Serum Institut fungerer både som et primært diagnostisk laboratorium og nationalt referencelaboratorium for enteropatogene bakterier. Referencelaboratoriet udfører artsidentifikation og subtypning af tarmpatogene bakterier indsendt af de danske klinisk mikrobiologiske afdelinger. Dette omfatter bl.a. typningsbaseret overvågning af Clostridium difficile PCR ribotype 027 for de nationale sundhedsmyndigheder.
Undersøgelser
Alle undersøgelser er DANAK akkrediterede efter ISO/IEC 17025 standarden.
- Artsidentifikation af aerobe og anaerobe tarmpatogene bakterier
-
Salmonella serotypning efter Kauffmann-White skema af LPS (O-antigener) og flageller (H-antigener)
- O-gruppering af Shigella subgrupper (S. dysenteriae, S. flexneri, S. boydii og S. sonnei)
- O-gruppering og biotypning af Yersinia enterocolitica og Vibrio cholerae
- Genotypisk artsbestemmelse af termofile Campylobacter arter
- Virulenskarakterisering og serotypning af diaréfremkaldende E. coli
- Genotypisk bestemmelse af Clostridium difficile toksiner inklusive påvisning af 18 bp markør (C. difficile PCR ribotype 027) i det regulerende toksin gen (tcdC)
Forskning og udvikling
- Molekylærbiologisk artsidentifikation af tarmpatogene bakterier
- Patogenese af non-typhoide/typhoide og monofasiske Salmonella
- Ikke-erkendte bakterielle årsager til gastroenteritis
- Identifikation af nye virulensfaktorer i diaréfremkaldende E. coli
- Cytotoksicitet af in vitro antibiotikainduceret toksinudskillelse hos tarmpatogene bakterier
Rapportering
- Annual report on Zoonoses, DTU Food, National Food Institute
- Årlig DANMAP rapport
- Epi-nyt: Shigellose, VTEC/HUS og kolera er individuelt anmeldelsespligtige sygdomme, der rapporteres ugentligt
- Epi-nyt: Ugentlig rapportering af laboratoriepåviste infektioner (Campylobacter, Salmonella, Yersinia enterocolitica, Shigella, Vibrio cholerae og diaréfremkaldende E. coli)
- Epi-nyt: Årsoversigter over zoonotiske tarminfektioner (Salmonella, Campylobacter, Yersinia enterocolitica og VTEC)
Deltagelse i EQA (external quality assurance) programmer
- WHO global foodborne infections network EQA system on serotyping and susceptibility testing of Salmonella and Shigella strains
- Food and Waterborne Disease Network (FWD-Net) of the European Centre for Disease control (ECDC) on serotyping, phagetyping and antimicrobial susceptibility of Salmonella strains
- UK NEQAS for general microbiology
- Sero- og virulenstypning af Verocytotoxin producerende E. coli (VTEC), WHO Collaborating centre for Reference and Research on Escherichia and Klebsiella, SSI
Sidst redigeret 31. august 2010